Στη βιολογική µελισσοκοµία, τα µελίσσια βρίσκονται όσο το δυνατό πιο κοντά (σε ακτίνα 3 km) σε βιολογικές καλλιέργειες ή σε αυτοφυή βλάστηση και οπωσδήποτε µακριά από περιοχές, όπως αστικά κέντρα και βιοµηχανοποιηµένες περιοχές ή σηµεία συγκέντρωσης απορριµµάτων. Η τεχνητή διατροφή των µελισσών, επιτρέπεται µόνο σε εξαιρετικά δύσκολες συνθήκες, όπου πιθανόν να απειλείται η επιβίωση τους, όπως για παράδειγµα σε κακές καιρικές συνθήκες. Αυτό γίνεται µόνο µε τροφές που επιτρέπονται στη βιολογική µελισσοκοµία.

Η χρήση φαρµακευτικών σκευασµάτων και αντιβιοτικών για την αντιµετώπιση ασθενειών, δεν επιτρέπεται ούτε για προληπτικούς, ούτε για θεραπευτικούς λόγους, προκειµένου αυτά να µην µεταφερθούν από τις µέλισσες στο µέλι.